Ogólny Rezystom

Ten znacznik ocenia Twój Resistoma, czyli pełny katalog genów oporności na antybiotyki obecnych w DNA Twojego ekosystemu jelitowego. Posiadanie resistomu o wysokim obciążeniu oznacza, że Twoje jelita stały się "rezerwuarem" lub magazynem superbakterii. Chociaż te bakterie nie powodują obecnie żadnej choroby, stanowią one ciche zagrożenie kliniczne: jeśli w przyszłości zachorujesz na infekcję, zwykłe metody leczenia mogą okazać się nieskuteczne.

Mikroorganizmy toczą ze sobą wojnę od milionów lat, używając jako broni naturalnych antybiotyków. Aby przetrwać te ataki, opracowały „biologiczne tarcze”: geny oporności na antybiotyki (ARG).

Obecny problem polega na tym, że powszechne stosowanie antybiotyków w medycynie przekształciło ludzkie jelita w rezerwuar oporności. Za każdym razem, gdy przyjmujesz antybiotyk o szerokim spektrum działania, niszczysz wrażliwe bakterie, ale przypadkowo selekcjonujesz te, które posiadają geny umożliwiające im przetrwanie.

Co najbardziej niepokojące, bakterie posiadają zdolność, której ludzie nie mają: poziomego transferu genów. Jeśli nieszkodliwa bakteria w Twoich jelitach posiada gen sprawiający, że jest odporna na penicylinę, może „skopiować” ten gen i podarować go inwazyjnej, patogennej bakterii (jak agresywna E. coli), uzbrajając ją i czyniąc ją niewrażliwą na pewne metody leczenia przeciwdrobnoustrojowego.

Obciążenie twojego resistomu nie wpływa na codzienne trawienie, ale jest kluczowym wskaźnikiem twojego bezpieczeństwa medycznego i epidemiologicznego:

• Przyszłe niepowodzenie terapeutyczne: Jeśli rozwinie się u Ciebie infekcja, a powodująca ją bakteria nabędzie pewne geny oporności z Twojego jelita, antybiotyki pierwszej linii przepisane przez lekarza mogą nie zadziałać, przedłużając chorobę i jej ryzyko.
• Powikłania pooperacyjne: Osoby z silnie obciążonym resistomem mają statystycznie większe ryzyko poważnych i nieuleczalnych infekcji po rutynowych operacjach lub terapiach obniżających odporność (takich jak chemioterapia).
• Cicha transmisja: Możesz być bezobjawowym nosicielem. Możesz przenosić te komensalne "superbakterie" na wrażliwe osoby w Twoim otoczeniu (małe dzieci, osoby starsze lub członków rodziny z osłabioną odpornością) poprzez codzienny kontakt.

Ocena resistomu jest jedną z najbardziej zaawansowanych i unikalnych zastosowań metagenomicznego sekwencjonowania Shotgun. Tradycyjne testy (takie jak hodowle na płytkach) mogą wykryć oporność tylko jednej bakterii na raz, pod warunkiem, że rośnie ona w laboratorium. Metagenomika natomiast analizuje całe DNA obecne w próbce.

Nasz bioinformatyczny pipeline mapuje miliony odczytów genetycznych do bazy danych genów oporności na antybiotyki. Określamy względne nagromadzenie genów, które zapewniają oporność na wiele klas leków, w tym: Beta-laktamy (penicyliny, cefalosporyny), tetracykliny, makrolidy, aminoglikozydy, fluorochinolony itp.

Raport szczegółowo opisuje obciążenie genetyczne dla każdej klasy antybiotyków. Wysoki wynik w określonej klasie to ważna informacja, którą możesz podzielić się ze swoim lekarzem przed leczeniem antybiotykowym. Interwencja kliniczna w przypadku bardzo obciążonego resistomu nie oznacza przyjmowania większej liczby leków, lecz wręcz przeciwnie: unikania empirycznego stosowania antybiotyków, gdy tylko jest to możliwe, i stosowania agresywnych strategii repopulacji z wykluczającymi probiotykami w celu wyparcia opornych szczepów.