Algemeen Resistoom

Deze marker evalueert uw Resistoom, dat wil zeggen, de complete catalogus van genen die resistent zijn tegen antibiotica en die aanwezig zijn in het DNA van uw darmecosysteem. Een resistoom met een hoge belasting hebben, betekent dat uw darm een ​​"reservoir" of opslagplaats voor superresistentie bacteriën is geworden. Hoewel deze bacteriën op dit moment geen ziekte bij u veroorzaken, vormen ze een stil klinisch risico: als u in de toekomst een infectie oploopt, kunnen de gebruikelijke medische behandelingen mislukken.

Micro-organismen voeren al miljoenen jaren oorlog tegen elkaar, waarbij ze natuurlijke antibiotica als wapens gebruiken. Om deze aanvallen te overleven, ontwikkelden ze "biologische schilden": genen voor antibioticaresistentie (ARG's).

Het moderne probleem is dat het wijdverbreide gebruik van antibiotica in de geneeskunde de menselijke darm heeft veranderd in een reservoir van resistentie. Elke keer dat je een breed-spectrum antibioticum inneemt, ruim je kwetsbare bacteriën op, maar selecteer je per ongeluk degenen die de genen hebben om te overleven.

Het meest alarmerende is dat bacteriën een vaardigheid bezitten die wij mensen niet hebben: Horizontale Genoverdracht. Als een onschadelijke bacterie in je darmen een gen heeft dat hem resistent maakt tegen penicilline, kan hij dat gen "kopiëren" en weggeven aan een invasieve pathogene bacterie (zoals een agressieve E. coli), waardoor deze wordt bewapend en onkwetsbaar wordt voor bepaalde antimicrobiële behandelingen.

De belasting van uw resistoom heeft geen invloed op uw dagelijkse spijsvertering, maar het is een vitale marker voor uw medische en epidemiologische veiligheid:

• Toekomstig Therapeutisch Falen: Als u een infectie ontwikkelt en de veroorzakende bacterie bepaalde resistentiegenen uit uw darmen verkrijgt, werken de door uw arts voorgeschreven antibiotica van de eerste lijn mogelijk niet meer, wat de ziekte en de bijbehorende risico's verlengt.
• Chirurgische Complicaties: Mensen met een zwaar belast resistoom hebben een statistisch groter risico op ernstige en onbehandelbare infecties na routinematige operaties of immuunsuppressieve behandelingen (zoals chemotherapie).
• Stille Overdracht: U kunt een asymptomatische drager zijn. U kunt deze commensaal "superbacteriën" overdragen aan kwetsbare personen in uw omgeving (jonge kinderen, ouderen of immuungecompromitteerde familieleden) via dagelijks contact.

De evaluatie van het resistoom is een van de meest geavanceerde en unieke toepassingen van Shotgun metagenomische sequencing. Traditionele tests (zoals kweek op plaat) kunnen de resistentie van slechts één bacterie tegelijk detecteren, mits deze in het laboratorium groeit. Metagenomica daarentegen scant alle DNA in het monster.

Onze bio-informatica pipeline mapt miljoenen genetische reads tegen de database van genen voor antibioticaresistentie. We kwantificeren de relatieve abundantie van genen die resistentie tegen meerdere klassen van geneesmiddelen verlenen, waaronder: Beta-lactams (Penicillines, Cefalosporines), Tetracyclines, Macroliden, Aminoglycosiden, Fluoroquinolones, enz.

Het rapport detailleert de genetische belasting per klasse van antibiotica. Een hoge score in een specifieke klasse is belangrijke informatie die u met uw arts kunt delen voordat u een antibioticabehandeling ondergaat. Klinische interventie bij een zeer beladen resistoom betekent niet meer medicijnen innemen, maar juist het tegenovergestelde: het vermijden van empirisch antibioticagebruik waar mogelijk en het toepassen van agressieve exclusie-probiotica strategieën om resistente stammen te verdringen.