Allmänt resistom

Denna markör utvärderar ditt Resistom, det vill säga, den kompletta katalogen av antibiotikaresistensgener som finns i ditt tarmekosystems DNA. Att ha ett resistom med hög belastning innebär att din tarm har blivit en "reservoar" eller ett lager av superbakterier. Även om dessa bakterier inte orsakar dig någon sjukdom just nu, utgör de en tyst klinisk risk: om du drabbas av en infektion i framtiden, kan vanliga medicinska behandlingar misslyckas.

Mikroorganismer har stridit mot varandra i miljontals år och använt naturliga antibiotika som vapen. För att överleva dessa attacker utvecklade de "biologiska sköldar": antibiotikaresistensgener (ARG).

Det moderna problemet är att den utbredda användningen av antibiotika inom sjukvården har förvandlat människans tarm till ett reservoar för resistens. Varje gång du tar ett bredspektrumantibiotikum utrotar du sårbara bakterier, men råkar samtidigt selektera de som har generna för att överleva.

Det mest oroande är att bakterier har en förmåga som människor inte har: horisontell genöverföring. Om en ofarlig bakterie i din tarm har en gen som gör den resistent mot penicillin, kan den "kopiera" den genen och ge bort den till en invaderande patogen bakterie (som en aggressiv E. coli), vilket beväpnar den och gör den immun mot vissa antimikrobiella behandlingar.

Belastningen av ditt resistom påverkar inte din dagliga matsmältning, men det är en viktig markör för din medicinska och epidemiologiska säkerhet:

• Framtida behandlingssvikt: Om du utvecklar en infektion och den orsakande bakterien förvärvar vissa resistensgener från din tarm, kan de förstahandsantibiotika som din läkare ordinerar inte fungera, vilket förlänger sjukdomen och dess risker.
• Kirurgiska komplikationer: Personer med ett högbelastat resistom har en statistiskt sett högre risk att drabbas av allvarliga och obotliga infektioner efter vanliga operationer eller behandlingar som dämpar immunsystemet (som kemoterapi).
• Tyst överföring: Du kan vara en asymtomatisk bärare. Du kan överföra dessa kommensala "superbakterier" till sårbara personer i din omgivning (små barn, äldre eller immunsupprimerade familjemedlemmar) genom daglig kontakt.

Utvärderingen av resistomet är en av de mest avancerade och unika tillämpningarna av Shotgun metagenomisk sekvensering. Traditionella tester (som plattodlingar) kan bara upptäcka resistens hos en bakterie i taget, förutsatt att den växer i laboratoriet. Metagenomik, å andra sidan, skannar allt DNA som finns i provet.

Vår bioinformatiska pipeline mappar miljontals genetiska läsningar mot databasen över antibiotikaresistensgener. Vi kvantifierar den relativa förekomsten av gener som ger resistens mot flera läkemedelsklasser, inklusive: Beta-laktamer (Penicilliner, Cefalosporiner), Tetracykliner, Makrolider, Aminoglykosider, Fluorokinoloner, etc.

Rapporten detaljerar den genetiska belastningen per varje antibiotikaklass. Ett högt resultat i en specifik klass är viktig information som du kan dela med din läkare före en antibiotikabehandling. Klinisk intervention vid ett mycket belastat resistom innebär inte att ta mer medicin, utan tvärtom: att undvika empirisk användning av antibiotika när det är möjligt och att tillämpa aggressiva strategier för återbefolkning med exkluderande probiotika för att förskjuta resistenta stammar.