Общий резистом

Этот маркер оценивает ваш Резистом, то есть полный каталог генов устойчивости к антибиотикам, присутствующих в ДНК вашей кишечной экосистемы. Высокая нагрузка на резистом означает, что ваш кишечник превратился в «резервуар» или хранилище супербактерий. Даже если эти бактерии в данный момент не вызывают у вас заболевания, они представляют собой скрытую клиническую опасность: если в будущем вы заразитесь инфекцией, обычные методы лечения могут оказаться неэффективными.

Микроорганизмы воюют друг с другом миллионы лет, используя природные антибиотики в качестве оружия. Чтобы выжить в этих атаках, они разработали "биологические щиты": гены устойчивости к антибиотикам (ARG).

Современная проблема заключается в том, что широкое применение антибиотиков в медицине превратило кишечник человека в резервуар устойчивости. Каждый раз, когда вы принимаете антибиотик широкого спектра действия, вы уничтожаете уязвимые бактерии, но случайно отбираете те, которые обладают генами для выживания.

Самое тревожное то, что у бактерий есть способность, которой мы, люди, не обладаем: горизонтальный перенос генов. Если безвредная бактерия в вашем кишечнике имеет ген, делающий ее устойчивой к пенициллину, она может "скопировать" этот ген и подарить его инвазивной патогенной бактерии (например, агрессивной кишечной палочке), вооружив ее и сделав неуязвимой для определенных противомикробных методов лечения.

Загрузка вашего резистома не влияет на ваше повседневное пищеварение, но является жизненно важным маркером вашей медицинской и эпидемиологической безопасности:

• Будущий терапевтический провал: Если у вас развивается инфекция, а вызывающая бактерия приобретает определенные гены устойчивости из вашего кишечника, антибиотики первого выбора, назначенные вашим врачом, могут не сработать, что приведет к затяжной болезни и связанным с ней рискам.
• Хирургические осложнения: Люди с высокой нагрузкой резистома подвергаются статистически более высокому риску тяжелых и неизлечимых инфекций после обычных операций или иммунодепрессивных процедур (таких как химиотерапия).
• Тихая передача: Вы можете быть бессимптомным носителем. Вы можете передавать эти комменсальные "супербактерии" уязвимым людям в вашем окружении (маленьким детям, пожилым людям или членам семьи с ослабленным иммунитетом) через ежедневный контакт.

Оценка резистома является одним из самых передовых и уникальных применений метагеномного секвенирования Shotgun. Традиционные тесты (например, посевы на чашках) могут обнаружить устойчивость только одной бактерии за раз, при условии, что она растет в лаборатории. Метагеномика, напротив, анализирует всю ДНК, присутствующую в образце.

Наш биоинформатический конвейер сопоставляет миллионы генетических прочтений с базой данных генов устойчивости к антибиотикам. Мы количественно оцениваем относительное изобилие генов, которые обеспечивают устойчивость к нескольким классам препаратов, включая: бета-лактамы (пенициллины, цефалоспорины), тетрациклины, макролиды, аминогликозиды, фторхинолоны и т. д.

В отчете подробно указана генетическая нагрузка для каждого класса антибиотиков. Высокий результат для определенного класса является важной информацией, которую вы можете сообщить своему врачу перед антибиотикотерапией. Клиническое вмешательство в случае очень высокой резистомной нагрузки не подразумевает прием большего количества лекарств, а наоборот: избегание эмпирического использования антибиотиков, когда это возможно, и применение агрессивных стратегий восстановления с помощью вытесняющих пробиотиков для замены устойчивых штаммов.