Composição Viral Detalhada

O Viroma Intestinal é a coleção de todos os vírus presentes no seu intestino.

Longe de serem um sinal de doença, a imensa maioria destes vírus são bacteriófagos ("devoradores de bactérias") que não infectam as células humanas, mas sim regulam as populações bacterianas.

Esta análise avalia a diversidade destes agentes reguladores e deteta marcadores virais dietéticos que servem como indicadores de qualidade nutricional.

Quando pensamos em vírus, geralmente pensamos em gripe ou infeções. No entanto, o seu intestino alberga biliões de vírus que são essenciais para a sua saúde. Estes organismos formam a denominada "Matéria Negra" do microbioma, devido ao seu grande desconhecimento e complexidade. Os componentes principais que analisamos são:

• Bacteriófagos (Fagos): São os "predadores" naturais das bactérias. Atuam como um sistema de controlo de qualidade, infetando e eliminando bactérias específicas se estas crescerem demasiado. Um viroma diverso sugere um ecossistema bacteriano dinâmico e bem controlado.
• Vírus Vegetais: O mais famoso é o Pepper Mild Mottle Virus (PMMoV). É um vírus que infeta os pimentos e malaguetas. Não afeta os humanos, mas encontrá-lo na sua amostra é um excelente sinal: demonstra que come vegetais reais e não apenas processados.

Embora não infectem as suas células, o viroma tem um impacto indireto mas profundo na sua fisiologia:

• Regulação do Ecossistema (Modelo Predador-Presa): Os fagos evitam que uma única espécie bacteriana domine o intestino. Se uma bactéria crescer descontroladamente, os seus fagos específicos multiplicam-se e reduzem a sua população, mantendo a biodiversidade.
• Transferência de Genes: Os vírus podem transportar genes de uma bactéria para outra. Isto pode ser benéfico (transferindo capacidades metabólicas) ou prejudicial (transferindo genes de resistência a antibióticos), pelo que monitorizar o "viroma" é fundamental para a segurança clínica.
• Imunidade Trans-Reino: Investigação recente sugere que alguns fagos podem aderir à camada mucosa do intestino, formando uma barreira defensiva que protege o tecido humano contra a invasão bacteriana.

O estudo do viroma representa a fronteira técnica da metagenómica. Ao contrário das bactérias (que têm o gene 16S) ou dos fungos (ITS), os vírus não partilham um gene marcador universal, o que torna impossível detetá-los com testes convencionais. Apenas a sequenciação Shotgun profunda permite recuperar as suas sequências genéticas.

O nosso pipeline bioinformático utiliza bases de dados virais especializadas para filtrar primeiro o ADN humano e bacteriano. Posteriormente, identificamos as sequências virais por homologia com famílias conhecidas (Siphoviridae, Myoviridae, Podoviridae) e vírus específicos "crípticos" de alta prevalência humana, como o crAssphage (presente em 50% da população mundial e marcador de contaminação humana) e o PMMoV (marcador dietético). Reporta-se a presença/ausência e a abundância relativa da fração viral mapeável.