विस्तृत वायरल संरचना

आंतों का वायरोम आपके आंत में मौजूद सभी वायरसों का संग्रह है।

बीमारी का संकेत होने के बजाय, इन वायरसों में से अधिकांश बैक्टीरियोफेज ("बैक्टीरिया को खाने वाले") हैं जो मानव कोशिकाओं को संक्रमित नहीं करते हैं, बल्कि बैक्टीरिया की आबादी को नियंत्रित करते हैं।

यह विश्लेषण इन नियामक एजेंटों की विविधता का मूल्यांकन करता है और आहार संबंधी वायरल मार्करों का पता लगाता है जो पोषण संबंधी गुणवत्ता के संकेतक के रूप में काम करते हैं।

जब हम वायरस के बारे में सोचते हैं, तो हम आमतौर पर फ्लू या संक्रमण के बारे में सोचते हैं। हालांकि, आपकी आंत में खरबों वायरस होते हैं जो आपके स्वास्थ्य के लिए आवश्यक हैं। ये जीव माइक्रोबायोम के तथाकथित "डार्क मैटर" बनाते हैं, उनके महान अज्ञान और जटिलता के कारण। मुख्य घटक जिनका हम विश्लेषण करते हैं वे हैं:

• बैक्टीरियोफेज (फेज): वे बैक्टीरिया के प्राकृतिक "शिकारी" हैं। वे एक गुणवत्ता नियंत्रण प्रणाली के रूप में कार्य करते हैं, विशिष्ट बैक्टीरिया को संक्रमित करते हैं और हटाते हैं यदि वे बहुत अधिक बढ़ते हैं। एक विविध वायरोम एक गतिशील और अच्छी तरह से नियंत्रित बैक्टीरियल पारिस्थितिकी तंत्र का सुझाव देता है।
• वनस्पति वायरस: सबसे प्रसिद्ध पेपर माइल्ड मोटल वायरस (PMMoV) है। यह एक वायरस है जो मिर्च और चिली को संक्रमित करता है। यह मनुष्यों को प्रभावित नहीं करता है, लेकिन आपके नमूने में इसे ढूंढना एक उत्कृष्ट संकेत है: यह दर्शाता है कि आप केवल प्रसंस्कृत के बजाय वास्तविक सब्जियां खाते हैं।

हालांकि वे आपकी कोशिकाओं को संक्रमित नहीं करते हैं, वायरोम आपकी शारीरिक रचना पर अप्रत्यक्ष लेकिन गहरा प्रभाव डालता है:

• पारिस्थितिकी तंत्र का विनियमन (शिकारी-शिकार मॉडल): फैग एक ही बैक्टीरिया प्रजाति को आंत पर हावी होने से रोकते हैं। यदि कोई बैक्टीरिया बेलगाम हो जाता है, तो उसके विशिष्ट फैग गुणा हो जाते हैं और उनकी आबादी को कम कर देते हैं, जिससे जैव विविधता बनी रहती है।
• जीन स्थानांतरण: वायरस एक बैक्टीरिया से दूसरे बैक्टीरिया में जीन ले जा सकते हैं। यह फायदेमंद (मेटाबोलिक क्षमताओं का स्थानांतरण) या हानिकारक (एंटीबायोटिक प्रतिरोध जीन का स्थानांतरण) हो सकता है, इसलिए नैदानिक ​​सुरक्षा के लिए "वायरोम" की निगरानी करना महत्वपूर्ण है।
• ट्रांस-किंगडम इम्युनिटी: हालिया शोध से पता चलता है कि कुछ फैग आंत की श्लेष्मा परत से जुड़ सकते हैं, एक रक्षात्मक बाधा बना सकते हैं जो जीवाणु आक्रमण के खिलाफ मानव ऊतक की रक्षा करती है।

विलोम का अध्ययन मेटाजेनोमिक्स की तकनीकी सीमा का प्रतिनिधित्व करता है। बैक्टीरिया (जिनमें 16S जीन होता है) या कवक (ITS) के विपरीत, वायरस एक सार्वभौमिक मार्कर जीन साझा नहीं करते हैं, जिससे पारंपरिक परीक्षणों से उनका पता लगाना असंभव हो जाता है। केवल गहन शॉटगन अनुक्रमण उनकी आनुवंशिक अनुक्रमों को पुनर्प्राप्त करने की अनुमति देता है।

हमारा बायोइनफॉरमैटिक पाइपलाइन पहले मानव और जीवाणु डीएनए को फ़िल्टर करने के लिए विशेष वायरल डेटाबेस का उपयोग करता है। बाद में, हम ज्ञात परिवारों (सिफोविरिडे, मायोविरिडे, पोडोविरिडे) और उच्च मानव प्रसार वाले "गुप्त" विशिष्ट वायरस, जैसे क्रैसफैज (विश्व जनसंख्या के 50% में मौजूद और मानव संदूषण का मार्कर) और पी.एम.एम.ओ.वी (आहार मार्कर) के साथ समरूपता के माध्यम से वायरल अनुक्रमों की पहचान करते हैं। मैपिंग योग्य वायरल अंश की उपस्थिति/अनुपस्थिति और सापेक्ष प्रचुरता की रिपोर्ट की जाती है।