Dégradation des Oxalates

Ce marqueur évalue la capacité génétique de votre écosystème intestinal à décomposer et à neutraliser les oxalates, des composés naturels (antinutriments) présents dans de nombreux aliments sains. Posséder une flore bactérienne capable de dégrader ces oxalates avant qu'ils ne passent dans votre circulation sanguine est votre principale ligne de défense naturelle contre la formation de calculs rénaux (pierres aux reins) et la déficience de certains minéraux.

Nous rencontrons ici l'un des grands paradoxes de la nutrition : des aliments universellement considérés comme des "superaliments" tels que les épinards, les betteraves, les amandes, le cacao pur ou la rhubarbe, sont extrêmement riches en acide oxalique. Les plantes produisent cet acide comme mécanisme de défense cristallin pour éviter d'être dévorées par les insectes.

Le corps humain ne possède aucune enzyme capable de digérer ces oxalates. Si vous les mangez et qu'ils parviennent intacts à votre intestin, ils sont absorbés dans le sang et voyagent jusqu'aux reins. Là, ils se lient au calcium en formant des cristaux pointus qui, s'ils s'accumulent, se transforment en douloureuses pierres rénales (pierres d'oxalate de calcium, qui représentent 80 % de toutes les pierres rénales). Heureusement, il existe des micro-organismes très spécialisés dans votre intestin qui se nourrissent de ces cristaux d'oxalate, les détruisant avant que votre corps n'ait la possibilité de les absorber.

La perte de cette capacité bactérienne (souvent après des traitements aux antibiotiques) a des conséquences directes :

• Risque de Calculs Rénaux (Lithiase urinaire) : Une faible capacité de dégradation des oxalates se traduit par une hyperoxalurie (excès d'oxalate dans l'urine). De nombreuses études montrent que les patients souffrant de calculs rénaux récurrents manquent presque complètement de bactéries dégradant les oxalates dans leur microbiote.
• Malabsorption des Minéraux : Dans l'intestin, l'oxalate agit comme un "aimant" ou chélateur. Il se lie fortement au calcium, au magnésium, au zinc et au fer de vos aliments, empêchant ainsi votre corps d'absorber ces nutriments vitaux. Les bactéries dégradant les oxalates libèrent ces minéraux, améliorant votre nutrition.
• Inflammation Systémique et Douleurs Articulaires : Bien que moins fréquent, chez les personnes souffrant d'une perméabilité intestinale accrue (intestin qui fuit) et d'une faible dégradation, les cristaux d'oxalate peuvent se déposer dans d'autres tissus corporels, exacerbant les douleurs articulaires, musculaires et même des conditions telles que la vulvodynie.

L'évaluation du potentiel de dégradation des oxalates est réalisée par métagénomique Shotgun, en recherchant spécifiquement la machinerie enzymatique nécessaire à cette voie métabolique.

Au niveau bioinformatique, nous cartographions l'abondance de deux gènes clés : oxc (oxalyl-CoA décarboxylase) et frc (formyl-CoA transférase). Dans l'écosystème humain, l'espèce reine incontestée de ce processus est Oxalobacter formigenes, une bactérie anaérobie stricte pour laquelle l'oxalate est sa seule source d'énergie (dégradateur obligatoire). Elle est extrêmement sensible aux antibiotiques courants. De plus, nous avons évalué la présence de dégradateurs « facultatifs » (bactéries qui peuvent dégrader l'oxalate en cas de pénurie d'autres sources), incluant des souches spécifiques de Lactobacillus (ex. L. acidophilus, L. plantarum) et Bifidobacterium (ex. B. animalis).

Une faible capacité nécessite une double intervention diététique : modérer la consommation d'aliments très riches en oxalates (ou des techniques culinaires comme faire bouillir les épinards et jeter l'eau, qui élimine une grande partie de l'acide) et assurer un apport adéquat de calcium dans le même repas pour précipiter l'oxalate dans l'intestin, tout en tentant de repeupler la flore avec des probiotiques possédant les gènes oxc/frc.