Sienitasapaino

Tämä markkeri arvioi suolistosi sienien ja hiivojen yhteisön (mikrobiomisi) ekologista tasapainoa. Erityisesti se analysoi yleensä hyödyllisten tai neutraalien hiivojen (kuten Saccharomyces) ja oportunististen hiivojen (kuten Candida) välistä suhdetta. Sopiva tasapaino on välttämätön suoliston tulehduksen ehkäisemiseksi, sokerinhimon hallitsemiseksi ja sieni-infektioiden (SIFO) estämiseksi.

Vaikka sienet muodostavat alle 0,1 % suolistosi mikro-organismien kokonaismäärästä, niiden koko ja tehokas metabolinen koneisto antavat niille merkittävän vaikutuksen immuunijärjestelmääsi.

Terveessä suolistossa bakteerit ja sienet kilpailevat jatkuvasti keskenään. Hyödylliset bakteerit pitävät sienet kurissa kilpailemalla ruoasta ja tilasta sekä erittämällä happoja, jotka hidastavat niiden kasvua.

Ongelma ilmenee, kun tämä tasapaino häiriintyy (esimerkiksi antibioottikuurin jälkeen, joka tuhoaa bakteereja, tai liian sokeripitoisen ruokavalion vuoksi). Tässä tilanteessa opportunistiset hiivat, kuten Candida albicans, hyödyntävät tyhjää tilaa moninkertaistuakseen nopeasti. Candida on normaali suoliston asukas, mutta kun se kasvaa hallitsemattomasti, se muuttuu vaarattomasta hiivamaisesta muodosta invasiiviseksi "hyyfimuodoksi" (säiemäinen), joka voi läpäistä suoliston seinämän. Sitä vastoin hiivat, kuten Saccharomyces cerevisiae (tai boulardii), toimivat rauhallisina säätelijöinä auttaen ruoansulatusta ja kilpaillen Candidaa vastaan vahingoittamatta kudosta.

Sienitasapainon järkkyminen opportunististen lajien hyväksi johtaa hyvin tyypillisiin kliinisiin seurauksiin:

• Hallitsemattomat sokerinhimot: Hiivat, kuten Candida, syövät lähes yksinomaan yksinkertaisia sokereita. Liiallisen kasvun aikana nämä organismit voivat vapauttaa molekyylejä, jotka muuttavat aivojen välittäjäaineita ja luovat voimakkaan biologisen tarpeen syödä makeisia.
• Aivosumu ja väsymys: Hiivan hillitön hiilihydraattien käyminen suolistossa tuottaa myrkyllisiä sivutuotteita, kuten asetaldehydiä (alkoholin sukulainen). Tämä kuormittaa maksaa ja aiheuttaa "krapulan" kaltaisia oireita, kuten kroonista väsymystä ja keskittymisvaikeuksia.
• Turvotus ja SIFO: Ohutsuolen sienikasvu (SIFO) aiheuttaa nopeaa kaasua tuottavaa käymistä, mikä johtaa voimakkaaseen vatsan turvotukseen lähes välittömästi hiilihydraattien syömisen jälkeen.
• Uusiutuvat infektiot: Suoliston sienitasapainon häiriö toimii usein "reservuaarina" uusiutuville infektioille muissa limakalvoissa, kuten vaginaalisessa candidiasisissa tai suun sammaseessa.

Sienibalanssin arviointi suoritetaan Shotgun-metagenomisegmentoinnilla, mikä muodostaa bioinformatiikan haasteen erittäin alhaisen eukaryootti-DNA:n suhteen bakteeri-DNA:han nähden.

Algoritmimme suodattaa ja kartoittaa geneettiset lukemat erityisesti kuratoituja sienigenomien tietokantoja vastaan. Tätä toiminnallista merkkiainetta varten laskemme sienibalanssisuhteen jakamalla ohimenevien ja hyödyllisten kommensaalilajien (esim. Saccharomyces, Debaryomyces) yhdistetyn suhteellisen runsauden erittäin virulenssi- ja dimorfismipotentiaalin omaavien lajien (Candida, Malassezia) runsaudella.

Tasapainoinen suhde heijastaa hallittua mikrobiomia, jossa tyypillisesti hallitsee Saccharomyces (usein peräisin ruokavaliosta, leivästä, oluesta tai probiooteista) ja Candida-tasoja on havaittavissa vain vähän tai ei lainkaan. Kuitenkin Candida-dominanssi heijastaa ekosysteemiä, jossa opportunistiset hiivat ovat syrjäyttäneet sieni- ja bakteerikilpailijat. Kliinisesti tämä viittaa tiukan ruokavaliotoimenpiteen (vähäsokerinen ja hiivaton ruokavalio) tarpeeseen yhdistettynä luonnollisten sienilääkkeiden ja kilpailukykyisen bakteerirekolonisaation käyttöön.