Yksityiskohtainen bakteerikoostumus

Tämä analyysi erittelee "Bacteria"-kunnan, joka muodostaa suurimman osan kokonaismikrobimassastasi. Tunnistamme tarkasti DNA:lla, mitkä heimot, suvut ja lajit asuttavat suolistoasi, paljastaen tasapainon suurten toiminnallisten ryhmien (pääjaksojen) välillä ja tunnistamalla spesifisiä lajeja, jotka määrittelevät ainutlaatuisen aineenvaihduntaprofiilisi.

Suoliston bakteerit eivät ole pelkkiä isäntiä; ne muodostavat dynaamisen ekosysteemin, joka toimii lisäaineenvaihduntaelimenä. Jokainen bakteeriryhmä on kehittynyt ihmisen kanssa suorittamaan erityistehtäviä, joita omat solumme eivät pysty tekemään, kuten monimutkaisten kuitujen ruoansulatus tai välttämättömien vitamiinien synteesi.

Tämä analyysi luokittelee mikrobiotasi suuriin biologisiin pääjaksoihin, jotka määrittävät "aineenvaihduntajälkesi":

• Firmicutes: Yleensä yhdistetään tehokkaaseen energian uuttamiseen ruoasta. Ylimäärä voi liittyä suurempaan kalorien imeytymiseen.
• Bacteroidetes: Erikoistuneet suurten hiilihydraattimolekyylien hajottamiseen ja immuunivasteen säätelyyn tulehduksen välttämiseksi.
• Actinobacteria: Kriittinen ryhmä, johon kuuluvat Bifidobacteriumit, jotka ovat välttämättömiä suolistonesteen ylläpitämiseksi ja suojaamiseksi patogeeneilta.
• Proteobacteria: Pääjakso, joka sisältää korkean tulehduspotentiaalin omaavia organismeja (E. coli, Salmonella). Niiden kohonnut läsnäolo on yleensä kliininen merkki dysbioosista tai suoliston stressistä.

Näiden ryhmien osuuden ymmärtäminen antaa meille mahdollisuuden arvioida, onko ekosysteemisi konfiguroitu aineenvaihdunnan terveyttä varten vai esiintyykö siinä riskimalleja.

Bakteerikoostumus on suoliston terveyden sormenjälki.

Tasapainoinen dominanssi: Terve tasapaino Firmicutes- ja Bacteroidetes-ryhmien välillä liittyy vakaaseen painoon ja hyvään insuliinivasteeseen.

Suuri lajimonimuotoisuus: Mitä enemmän erilaisia lajeja sinulla on, sitä suurempi on "biologinen vakuutuksesi". Jos jokin laji pettää tai antibiootit poistavat sen, toiset voivat ottaa sen paikan (toiminnallinen redundanssi), suojellen sinua sairauksilta.

Patobionttien läsnäolo: "Opportunististen" bakteerien havaitseminen matalilla tasoilla on normaalia, mutta jos ne hallitsevat, ne voivat aiheuttaa kroonista tulehdusta, kaasua ja ravintoaineiden imeytymishäiriöitä.

Taksonominen karakterisointi tehdään korkeatasoisellaShotgun-metagenomisella sekvensoinnilla, joka yhdistetään edistyneeseen bioinformatiikka-analyysiin, joka perustuu klatspesifisten geenien tunnistamiseen. Toisin kuin tavanomaiset lisäystekniikat, jotka usein rajoittuvat ylempien taksonomisten resoluutioiden tasolle, tämä menetelmä mahdollistaa mikrobayhteisön tarkan erittelyn, saavuttaen lajitasoisen resoluution ja jopa erottaen spesifisiä kannoja saman suvun sisällä. Tämä on välttämätöntä hyödyllisten kommensaaliorganismien erottamiseksi potentiaalisesti patogeenisistä muunnoksista, joilla on pinnallisia geneettisiä samankaltaisuuksia.

Analyysiprosessi sisältää jokaisen taksonin suhteellisen runsauden tarkan kvantifioinnin, joka lasketaan kohdistettujen lukukertojen kattavuudesta kuratoituja referenssitietokantoja vastaan, jotka integroivat satoja tuhansia mikrobigenomia. Lisäksi järjestelmä pystyy tunnistamaan ja luokittelemaan organismeja, joita ei ole vielä onnistuneesti viljelty laboratoriossa. Tämä mahdollistaa paljon kattavamman ja realistisemman arvion ekosysteemin kokonaisbiodiversiteetistä, tavoittaen perinteisiltä viljelymenetelmiltä puuttuvan biologisen monimutkaisuuden.